广东省数据知识产权存证登记平台-证书详情

登记信息

AAV2病毒变体包装能力文库 已登记

数据申请号：

粤2024012300156
数据登记号：

SZ2024120001202.5
关键词：

AAV2变体、包装能力
登记时间：

2024-04-01
平台证书编号：

20240144000001202
数据处理者：

暂无
服务机构：

暂无
登记主体：

广州译码基因科技有限公司
法院编号：

广州互联网法院 - 35bd16b92f63596d4968806eca6598ad018ce1f4576412dcc0f5da54bdf6f9d0-749fc1a4;legalxchain

区块链信息

上链时间：

2024-01-23
所属区块链：

司法联盟链·广东省知识产权保护中心
证据指纹：

7c6dd4c0057c2dc13855d89794dee43e6da52b5879987ef662ebe70870af679def04ed6781893c1fffa09a4d153d2b3f73a7209c0e8cbfca08b5d9e3de7d3dc1
区块链存证证书编号：

LXM-GDIPI-23202401236434253632

数据信息

数据简介

AAV2病毒变体包装能力文库，是包含约11.7万种AAV2变体的衣壳序列及其包装能力分数的病毒文库。文库的设计方式是，在野生型AAV2衣壳蛋白561-588区域突变或在561-588区域任意一个或多个位点插入任意一个或多个氨基酸。依次进行序列合成，质粒构建和测序，病毒包装和测序，并用自研的方法分析测序数据，从而得到该文库。

数据来源：

自行产生
数据所属行业分类：

M75 科技推广和应用服务业

数据处理规则说明

对质粒库进行二代测序，分析测序结果，得到每条变体序列的读数，进而计算RPM值；对病毒库进行二代测序，分析测序结果，得到每条变体序列的读数，进而计算RPM值。整合质粒、病毒的RPM值，得到每个AAV变体的包装能力分数。若存在多组病毒库重复实验，则对多组病毒库测算出来的包装能力分数，在每一条变体的层面取均值。

应用场景描述

基因治疗是指将外源正常基因导入靶细胞，以纠正或代偿基因缺陷和异常引起的疾病，最终达到治疗目的的一种生物治疗方法。将外源正常基因导入靶细胞的工具称为基因治疗载体。基因治疗载体分为两大类：病毒载体（主要包括慢病毒、腺病毒、逆转录病毒、腺相关病毒等），非病毒载体（主要包括裸露DNA、脂质体、纳米载体等）。其中，腺相关病毒（AAV）是目前发现的一类结构最简单的单链DNA缺陷型病毒，需要辅助病毒（通常为腺病毒）参与复制，由于其安全性好、宿主细胞范围广、免疫源性低，在体内表达外源基因时间长等特点，被视为最有前途的基因治疗载体，在世界范围内的基因治疗和疫苗研究中得到广泛应用。然而，在AAV药物产业化阶段，因为给药浓度通常较高，意味着一次治疗所需的病毒载体量也更大，需要更高的成本，这也是为什么基因治疗药物的价格如何昂贵的原因之一。为了提高药物的可及性，进一步降低成本，提高AAV病毒载体的产量成为了最严峻的挑战之一。本文库诞生之后，利用数据可分析得到提高包装能力的关键motif、建立预测包装能力AI模型、设计高包装能力的新AAV病毒等，加速研发和生产的高包装能力AAV病毒变体的构建。

数据格式：

excel
数据更新频率：

其他
数据量：

134533

样例数据

seq:GACGAAGAGGAAATCAAGACAACCAATCCCGTGGCTACGGAGCCCTATGGTGATGTAGCGACCAACCTCCAGTCGGGCGAGACT；p_reads：327；p_db_reads：125364767；p_seed_rpm：2.6084；v_reads：107；v_db_reads：21880442；v_seed_rpm：4.8902；aa：DEEEIKTTNPVATEPYGDVATNLQSGET；score：0.906736699929575

数据结构样例

病毒包装性能.csv seq:AAV病毒的碱基序列 aa：AAV病毒的氨基酸序列 p_reads：质粒读数 p_db_reads：文库总质粒读数 p_seed_rpm：质粒RPM v_reads：病毒读数 v_db_reads：文库总病毒读数 v_seed_rpm：病毒RPM Score：AAV病毒包装能力

数据状态

2024-04-01

数据知识产权登记完成