广东省数据知识产权存证登记平台
登记信息
AAV2病毒变体小鼠肝脏组织感染能力文库Lib1 已登记
  • 数据申请号:

    粤2024012300158

  • 数据登记号:

    SZ2024120001203.6

  • 关键词:

    AAV2、感染能力

  • 登记时间:

    2024-04-01

  • 登记主体:

    广州译码基因科技有限公司

  • 平台证书编号:

    20240144000001203

  • 服务机构:

    暂无

  • 法院编号:

    广州互联网法院 - a89a491e7288e361d65c8168eb01745e67d34ceea5441e3c10ed9141fa2550d4-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间:

    2024-01-23

  • 所属区块链:

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹:

    7c6dd4c0057c2dc13855d89794dee43e6da52b5879987ef662ebe70870af679def04ed6781893c1fffa09a4d153d2b3f73a7209c0e8cbfca08b5d9e3de7d3dc1

  • 区块链存证证书编号:

    LXM-GDIPI-23202401236425549596

数据信息
数据简介
AAV2病毒变体小鼠肝脏组织感染能力文库Lib1,是包含约9.77万种AAV2变体的衣壳序列及其小鼠肝脏靶向分数的病毒文库。文库的设计方式是,在野生型AAV2衣壳蛋白561-588区域随机突变或在该区域内插入一个或多个氨基酸的随机多肽片段。依次进行(1)序列合成,(2)质粒构建,(3)在体外细胞培养皿中进行质粒转染以便包装病毒文库,(4)病毒文库测序,(5)病毒文库对小鼠给药,(6)小鼠肝脏组织取材和测序,(7)用自研的方法分析测序数据,从而得到该文库。最终该文库包含的数据条目有:AAV2病毒变体的碱基序列、氨基酸序列、病毒库中的病毒读数以及RPM、肝脏组织读数以及RPM、感染能力分数等。
  • 数据来源:

    自行产生

  • 数据所属行业分类:

    M75 科技推广和应用服务业

数据处理规则说明
对病毒文库进行二代测序,分析测序结果,得到每条变体序列的读数,进而计算RPM值(Read Per Million),称为变体的病毒RPM。 对小鼠肝脏取材处理后进行二代测序,分析测序结果,得到在小鼠肝脏样本中每条变体序列的读数,进而计算RPM值,称为变体的组织RPM。 利用公式根据变体的病毒RPM、组织RPM,计算得到变体对小鼠肝脏的组织靶向性分数。 若对多只小鼠的进行了相同文库的给药和取材测序实验,则可以对多只小鼠的肝脏组织中第i种病毒变体的感染能力分数取均值,作为该病毒变体的最终感染能力分数值。
应用场景描述
基因治疗是指将外源正常基因导入靶细胞,以纠正或代偿基因缺陷和异常引起的疾病,最终达到治疗目的的一种生物治疗方法。将外源正常基因导入靶细胞的工具称为基因治疗载体。腺相关病毒(AAV)由于其安全性好、宿主细胞范围广、免疫源性低,在体内表达外源基因时间长、良好的组织特异性等特点,被视为最有前途的基因治疗载体。 AAV血清型主要由其衣壳蛋白结构决定,不同血清型的AAV会影响其感染能力、组织特异性。目前AAV血清型种类只有10来种(AAV1~AAV10等),研究者也在积极地对AAV衣壳蛋白进行改造,开发出更多的、对特定组织感染能力更强或更弱的AAV变体。 其中,AAV2在眼部、肺部、肌肉等组织有一定的感染能力,对肝脏的感染能力也比较强,而在用AAV2治疗眼部疾病的时候,需要其尽可能少地感染肝脏,以便减小对被试者毒性。为了开发出高效靶向眼部组织、负靶向肝脏组织的AAV2新变体,构建了本文库。 本文库诞生后,利用数据可分析得到降低肝脏组织特异性靶向能力的关键motif、也可用于建立AI模型预测AAV2变体对小鼠肝脏感染能力、设计对小鼠眼部组织感染能力强且对肝脏感染能力更弱的新型AAV2变体病毒等
  • 数据格式:

    excel

  • 数据更新频率:

    其他

  • 数据量:

    97745

样例数据
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数据结构样例
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数据状态
  • 2025-08-05

    质押备案

    出质人:广州译码基因科技有限公司; 质权人:中国工商银行股份有限公司广州天平架支行; 合同签订时间:2025年07月28日
  • 2024-04-01

    数据知识产权登记完成