广东省数据知识产权存证登记平台-证书详情

登记信息

肺癌组织空间单细胞转录组表达量数据 已登记

数据申请号：

粤2024122600606
数据登记号：

SZ2024120014585.1
关键词：

肺癌，单细胞RNA测序，空间转录组
登记时间：

2025-01-13
平台证书编号：

20241244000014585
数据处理者：

暂无
服务机构：

暂无
登记主体：

珠海市博兆医疗科技有限公司
法院编号：

广州互联网法院 - a9fbb7484e7d7df1526b48cd8a50a6845b746ec48abe776e920dc8636bd93e36-749fc1a4;legalxchain

区块链信息

上链时间：

2024-12-26
所属区块链：

司法联盟链·广东省知识产权保护中心
证据指纹：

0c886af40ef7527165e6a3ffa886b25cc93ef1d862a21ff6f3ce5e9b8976c85c6da1aaa398e4b9aec68be246d3559157e532dbe6920b0c71c3f8d57b49e13a98
区块链存证证书编号：

LXM-GDIPI-23202412266014427247

数据信息

数据简介

肺癌组织空间单细胞转录组数据结合单细胞RNA测序与空间转录组技术，全面记录了肿瘤微环境中各类细胞的空间分布及其基因表达特征。数据涵盖肿瘤细胞、免疫细胞（如T细胞、B细胞、巨噬细胞）、成纤维细胞及其他基质细胞，详细展示了不同细胞类型在肿瘤组织中的空间位置及其功能特性。通过高分辨率的空间信息整合，研究者能够深入解析肿瘤异质性、免疫微环境的动态变化，以及不同细胞间的相互作用网络。特别是，该数据有助于揭示肿瘤细胞如何通过与免疫抑制性细胞或基质细胞的空间通讯机制来逃避免疫监视。同时，数据还能揭示肿瘤生长、侵袭与转移过程中关键分子和细胞的动态特征。该数据为肺癌的发病机制研究、免疫治疗策略优化以及精准医学的开发提供了重要依据，具有广泛的研究价值。

数据来源：

自行产生
数据所属行业分类：

M75 科技推广和应用服务业

数据处理规则说明

肺癌组织空间单细胞转录组数据处理遵循严格的标准化流程，确保数据的可靠性与高质量。首先，对原始数据进行预处理，通过质控筛选去除低质量细胞、背景噪声及异常基因表达值，例如删除线粒体基因表达比例过高或基因表达量低于特定阈值的细胞。随后，对基因表达矩阵进行归一化处理，消除因测序深度差异带来的偏倚，并结合空间位置信息提取关键特征，包括细胞的空间坐标、邻近关系及基因表达的空间相关性。在此基础上，通过方差分析或主成分分析筛选高变基因，并利用降维算法（如t-SNE或UMAP）进行数据可视化，识别不同细胞亚群及其空间分布特征。接着，通过聚类分析和已知标志基因对细胞群进行功能性注释，明确肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞等不同类型的生物学属性。同时，计算细胞通讯信号强度，揭示肿瘤细胞与其他细胞类型间的动态相互作用。最后，对所有数据进行匿名化处理，确保患者隐私和数据使用的合规性。通过上述流程，数据的完整性、一致性和生物学意义得到充分保障，为后续研究和应用提供了坚实基础。

应用场景描述

肺癌组织的空间单细胞转录组数据在疾病研究、药物开发及精准医学等领域具有重要应用价值。通过该数据可以系统解析肿瘤微环境中不同细胞类型的空间分布及其基因表达特征，揭示肿瘤细胞、免疫细胞（如T细胞、B细胞、巨噬细胞）及基质细胞之间的空间互作，探索免疫抑制区域的分布规律及肿瘤细胞逃避免疫监视的机制。在药物研究中，该技术能够评估抗肿瘤药物对微环境的影响，例如免疫检查点抑制剂如何激活免疫细胞或抑制肿瘤相关细胞的活性。还可以结合数据分析辅助药物筛选，预测潜在的脱靶效应，提高药物研发效率。

数据格式：

h5ad
数据更新频率：

其他
数据量：

500000

样例数据

fov Area AspectRatio x_FOV_px y_FOV_px Width 4-1BB B7-H3 Bcl-2 Beta-catenin CCR7 CD11b CD11c CD123 CD127 CD138 90 6000 0.75 100 600 120 2.3 3.8 2.5 4.8 2.0 3.0 2.2 3.5 4.5 5.0 110 7000 0.85 130 700 100 2.5 4.0 3.0 5.0 2.5 3.5 2.5 4.0 4.0 5.5 95 5500 0.78 105 550 110 2.2 3.5 2.8 4.5 2.2 3.2 2.0 3.2 4.2 4.8

数据结构样例

字段说明 fov（整数类型）：视野编号，表示单细胞图像所在的视野区域编号。 Area（整数类型）：单细胞的面积（像素单位）。 AspectRatio（浮点类型）：单细胞的长宽比，用于反映细胞形状特征。 x_FOV_px（整数类型）：单细胞在视野中水平方向的像素位置（范围内像素值）。 y_FOV_px（整数类型）：单细胞在视野中竖直方向的像素位置（范围内像素值）。 Width（整数类型）：单细胞宽度的像素值。标志物表达值 4-1BB, B7-H3, Bcl-2, Beta-catenin, CCR7, CD11b, CD11c, CD123, CD127, CD138（浮点类型）：这些字段表示单细胞上不同标志物的表达值。每个标志物对应一个具体的基因，其值为定量检测所得的表达强度，数值越大表明标志物在细胞中的表达越高。

数据状态

2025-01-13

数据知识产权登记完成