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登记信息
小鼠肿瘤耐药实验空间转录组数据 已登记
  • 数据申请号：

    粤2024122600609

  • 数据登记号：

    SZ2025120000032.6

  • 关键词：

    小鼠肿瘤，耐药实验，空间转录组测序

  • 登记时间：

    2025-01-19

  • 平台证书编号：

    20250144000000032

  • 数据处理者：

    暂无

  • 服务机构：

    暂无

  • 登记主体：

    珠海市博兆医疗科技有限公司

  • 法院编号：

    广州互联网法院 - 03d10cf60c7f0b6ce77b529719e71ecc35c0346fa3a946d04ab17df4f0394d55-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间：

    2025-01-08

  • 所属区块链：

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹：

    26379572265af612c23ddd90e54e60e0c488ab12495bf3530ecdaa6bc1541e10c46fed1eed303c2956fd60e14a2fa1c450b1c68961857e818f5f706bfc296d73

  • 区块链存证证书编号：

    LXM-GDIPI-23202501085790692473

数据信息
数据简介
小鼠肿瘤耐药实验数据通过先进的单细胞RNA测序技术与空间转录组技术相结合，系统性地记录了肿瘤组织中不同细胞类型的空间分布及其基因表达特征，特别关注耐药相关细胞亚群的动态变化。数据涵盖了肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞及其他相关细胞类型的详细转录组信息，精准捕捉了它们在肿瘤组织中的空间位置特性及功能差异。通过高分辨率的空间信息整合，研究者能够深入解析不同细胞类型在肿瘤微环境中的相互作用，以及肿瘤细胞在耐药形成过程中的分子机制和动态变化，为抗肿瘤药物耐药机制的研究提供了重要的数据支持和新的研究视角。
  • 数据来源：

    自行产生

  • 数据所属行业分类：

    M75 科技推广和应用服务业

数据处理规则说明
数据清洗阶段，从测序平台生成的基因表达矩阵和空间定位信息入手，采用标准化分析流程过滤掉低质量细胞及异常基因表达值，剔除受背景噪声或实验误差影响的空间点。针对缺失值采用合理的插补方法或直接剔除，确保数据完整准确，便于后续分析。特征处理阶段，采用数据分析工具对基因表达矩阵进行归一化处理，消除因测序深度或批次效应造成的系统性偏差。结合空间定位信息，提取细胞间的空间距离、基因表达相关性等特征，并通过相关性分析和特征选择算法筛选出关键基因和重要空间特征，构建优化的特征集。数据建模阶段，利用构建的特征集进行细胞聚类分析，结合标志基因注释方法实现不同细胞类型的精准分类，并通过降维算法（如t-SNE或UMAP）对数据进行可视化展示，呈现细胞在组织空间中的分布规律。计算数据一致性评分并评估空间分布模型的质量，确保分析结果的科学性和可靠性。数据匿名化和隐私保护阶段，对实验数据中的敏感信息进行脱敏处理，使用唯一编码代替，同时实施严格的数据安全管理措施，定期审查数据存储的完整性与安全性，确保匿名化措施的有效性。整体流程旨在为空间单细胞研究提供高质量的数据支持，推动研究结果的准确性与可重复性。
应用场景描述
肿瘤耐药机制解析：通过对小鼠肿瘤耐药模型关键组织的空间单细胞测序，深入研究耐药相关细胞类型的空间分布及基因表达特征。例如，在肿瘤微环境中，揭示耐药肿瘤细胞与免疫细胞、基质细胞之间的相互作用，探索耐药性形成过程中关键信号通路及其空间分布规律，为理解耐药机制提供重要依据。 耐药进化动态监测：空间单细胞测序可动态追踪肿瘤耐药进程中的细胞行为变化，研究耐药肿瘤细胞如何通过分化、迁移或空间定位调整来规避药物作用。例如，分析药物选择压力下的细胞进化轨迹，揭示耐药性细胞亚群的空间适应特性和动态变化。 肿瘤微环境改造：利用空间单细胞测序技术解析肿瘤耐药微环境中的关键细胞构成，研究免疫细胞和基质细胞在耐药性形成中的作用及其空间分布变化。例如，探索免疫抑制微环境如何支持耐药细胞的存活与扩展，识别微环境中关键的耐药促进因子。 药物联合治疗评估：在小鼠耐药模型中，通过空间单细胞测序技术评估联合治疗的效果，研究新药或联合用药对耐药细胞亚群及其微环境的空间调控作用。例如，监测免疫疗法或靶向治疗对耐药肿瘤细胞的抑制作用及其在肿瘤组织中的空间分布变化。
  • 数据格式：

    Excel

  • 数据更新频率：

    其他

  • 数据量：

    300

样例数据
详情见附件 附件下载
数据结构样例
字段说明 fov（整数类型）：视野编号，表示单细胞图像所在的视野区域编号。 Area（整数类型）：单细胞的面积（像素单位）。 AspectRatio（浮点类型）：单细胞的长宽比，用于反映细胞形状特征。 x_FOV_px（整数类型）：单细胞在视野中水平方向的像素位置（范围内像素值）。 y_FOV_px（整数类型）：单细胞在视野中竖直方向的像素位置（范围内像素值）。 Width（整数类型）：单细胞宽度的像素值。 标志物表达值 4-1BB, B7-H3, Bcl-2, Beta-catenin, CCR7, CD11b, CD11c, CD123, CD127, CD138（浮点类型）： 这些字段表示单细胞上不同标志物的表达值。每个标志物对应一个具体的基因，其值为定量检测所得的表达强度，数值越大表明标志物在细胞中的表达越高。
数据状态
  • 2025-01-19

    数据知识产权登记完成

管理单位：广东省市场监督管理局（知识产权局）

登记机构：广东省知识产权保护中心

网站备案号：粤ICP备19045762号

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