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登记信息
阴茎癌组织空间单细胞转录组表达量数据 已登记
  • 数据申请号：

    粤2024122600608

  • 数据登记号：

    SZ2025120000033.7

  • 关键词：

    阴茎癌组织，单细胞RNA测序，空间转录组

  • 登记时间：

    2025-01-19

  • 平台证书编号：

    20250144000000033

  • 数据处理者：

    暂无

  • 服务机构：

    暂无

  • 登记主体：

    珠海市博兆医疗科技有限公司

  • 法院编号：

    广州互联网法院 - 4bff33879acd46fe5149dd8e82d66035ccc29540edfd6618342ea74459c06797-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间：

    2025-01-08

  • 所属区块链：

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹：

    580663fc36be1cc9a1cda3a93d9038e70e6f667d3a5e455ce004e3845d58284bceb92b7ed71256d0de8b25bc20a123adaf0541dceea7d463dd20bc44986150f0

  • 区块链存证证书编号：

    LXM-GDIPI-23202501085793044584

数据信息
数据简介
阴茎癌组织的空间单细胞转录组数据通过先进的单细胞RNA测序技术与空间转录组技术相结合，系统性地记录了肿瘤组织中不同细胞类型的空间分布及其基因表达特征。数据涵盖了肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞及其他相关细胞类型的详细转录组信息，精准捕捉了它们在肿瘤微环境中的位置特性及功能差异。通过高分辨率的空间信息整合，研究者能够深入解析不同细胞类型在阴茎癌组织中的相互作用、免疫抑制微环境的形成机制以及细胞动态变化，为阴茎癌的发病机制研究和个性化治疗策略的制定提供了重要的数据支持。
  • 数据来源：

    自行产生

  • 数据所属行业分类：

    M75 科技推广和应用服务业

数据处理规则说明
空间单细胞转录组测序数据处理包括多个关键步骤，以确保数据的高质量和可靠性。首先，在数据清洗阶段，利用测序平台生成的基因表达矩阵和空间定位信息，采用标准化流程过滤低质量细胞和异常基因表达值，同时剔除受背景噪声或实验误差影响的空间点，并对小范围的缺失值进行插补或剔除，以确保数据的完整性和准确性。在特征提取阶段，对基因表达矩阵进行归一化处理，校正因测序深度或批次效应导致的偏差，同时结合空间信息提取细胞间的空间距离、基因表达相关性等关键特征，使用相关性分析和特征选择算法筛选出重要基因和空间特性，最终构建优化的特征集。在数据建模阶段，基于优化特征集进行细胞聚类分析，并结合标志基因信息对不同细胞类型进行精确注释，随后利用降维算法（如t-SNE或UMAP）可视化细胞在组织空间中的分布特征，同时评估数据一致性和空间分布规律，确保模型的质量和可靠性。最后，在隐私保护阶段，对实验数据中涉及的敏感信息（如样本编号或患者隐私信息）进行严格脱敏处理，以唯一编码替代实际信息，并采用严格的数据安全管理措施，定期审查数据存储的完整性和安全性，从而确保数据隐私保护和研究可信度。
应用场景描述
空间单细胞测序技术在阴茎癌研究中具有重要的应用价值，为解析肿瘤微环境和疾病机制提供了精细化的数据支持。通过对阴茎癌组织的空间单细胞测序，可以系统性地分析肿瘤组织中不同细胞类型的空间分布及其基因表达特征，深入揭示肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞在肿瘤微环境中的相互作用及动态变化。例如，可探索肿瘤微环境中免疫抑制现象的发生机制，识别特定免疫细胞亚群的功能状态及其空间定位，解析肿瘤细胞如何通过细胞间通讯塑造免疫抑制环境。该技术还可用于评估抗肿瘤药物在阴茎癌治疗中的作用机制，分析药物对免疫细胞激活或基质细胞功能调控的影响，监测肿瘤组织在药物作用下的空间变化，为个性化治疗方案的优化提供依据。此外，空间单细胞测序可助力转移机制的研究，通过比较原发灶和转移灶中的细胞类型及其空间分布模式，揭示肿瘤转移过程中关键细胞行为和基因调控网络的变化。在再生医学和损伤修复相关研究中，该技术还能用于评估阴茎癌术后组织修复过程中不同细胞类型的动态变化及其空间关系，为术后干预和再生治疗提供科学依据。总体而言，空间单细胞测序为阴茎癌的基础研究和临床应用提供了高分辨率的数据支持，有助于推动精准医学的发展。
  • 数据格式：

    Excel

  • 数据更新频率：

    其他

  • 数据量：

    300

样例数据
详情见附件 附件下载
数据结构样例
字段说明 fov（整数类型）：视野编号，表示单细胞图像所在的视野区域编号。 Area（整数类型）：单细胞的面积（像素单位）。 AspectRatio（浮点类型）：单细胞的长宽比，用于反映细胞形状特征。 x_FOV_px（整数类型）：单细胞在视野中水平方向的像素位置（范围内像素值）。 y_FOV_px（整数类型）：单细胞在视野中竖直方向的像素位置（范围内像素值）。 Width（整数类型）：单细胞宽度的像素值。 标志物表达值 4-1BB, B7-H3, Bcl-2, Beta-catenin, CCR7, CD11b, CD11c, CD123, CD127, CD138（浮点类型）： 这些字段表示单细胞上不同标志物的表达值。每个标志物对应一个具体的基因，其值为定量检测所得的表达强度，数值越大表明标志物在细胞中的表达越高。
数据状态
  • 2025-01-19

    数据知识产权登记完成

管理单位：广东省市场监督管理局（知识产权局）

登记机构：广东省知识产权保护中心

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