广东省数据知识产权存证登记平台
登记信息
佛山大学蛋白质组合关联度数据集 已登记
  • 数据申请号:

    粤2025101602178

  • 数据登记号:

    SZ2025120018445.1

  • 关键词:

    实验;蛋白质;Sum PEP Score;Coverage;Peptides

  • 登记时间:

    2025-11-15

  • 平台证书编号:

    20251044000018445

  • 数据处理者:

    暂无

  • 服务机构:

    暂无

  • 登记主体:

    佛山大学

  • 法院编号:

    广州互联网法院 - 87c21c4a7ea5f54d28e411783d96b2d3d5f793387730eda7fc8a956d11d57541-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间:

    2025-11-04

  • 所属区块链:

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹:

    d5f874f3ab3713aa349e27bef676ae8203e4929b4e5a51251c70b163b5b03e16355f382a0de963dfd199a4bf676b0d58103ec75f0c24be927d1f4960df667343

  • 区块链存证证书编号:

    LXM-GDIPI-23202511043827995013

数据信息
数据简介
本数据集源自佛山大学生物医学实验室的蛋白质谱鉴定研究,记录了技术鉴定的蛋白质的含量和特定肽段的质量、覆盖率、肽的数量等数据。数据通过检测获取并由人工记录,经过质谱检测、数据清洗、校验、存储、生物信息学分析后形成结构化数据集。该数据集可用于疾病发病机制研究、药物靶点发现、特殊表现蛋白发现等应用场景。
  • 数据来源:

    自行产生

  • 数据所属行业分类:

    M73 研究和试验发展

数据处理规则说明
1、数据清洗与标准化: 必填字段:蛋白名称、Sum PEP Score、Coverage%、#Peptides 缺失值处理:肽段数0.7) 异常值标记:Sum PEP Score超过均值±3SD时标黄 3、数据存储管理: 原始质谱数据:实验记录登记存储 分析结果数据:数据处理登记存储 4、数据处理分析 (1)蛋白组合关联度分析:计算Sum PEP Score、Coverage [%]、# Peptides指标列相邻两行的差值的绝对值, 将每一行(即每个蛋白)对应的各指标绝对值差值进行求和,最终得到每个蛋白对应的 “蛋白组合关联度” 数值 (2)与均值的差异(得分)分析:计算每个蛋白的Sum PEP Score与所有蛋白该得分均值的差异,突出蛋白得分的偏离程度。 (3)相对覆盖率:每个蛋白的Coverage [%]相对于最高Coverage [%]的比例,直观展示蛋白在覆盖率方面的相对重要性。
应用场景描述
1、蛋白组合关联度分析对于研究基因间的相互作用和调控网络有作用,可应用于疾病发病机制研究、药物靶点发现等领域。 2、与均值的差异可以突出每个基因得分相对于整体平均水平的偏离程度,有助于发现具有特殊表现的基因。 3、相对覆盖率直观地展示每个基因在覆盖率方面的相对重要性,方便在不同基因间进行比较。
  • 数据格式:

    excel表格

  • 数据更新频率:

    实时更新

  • 数据量:

    479

样例数据
序号 蛋白名称 Sum PEP Score Coverage [%] # Peptides 蛋白组合关联度 与均值的差异(得分) 相对覆盖率 1 TPM2 165.123 30 18 0 129.8640146 0.361445783 2 TUBA8 67.628 22 8 115.495 32.36901461 0.265060241 3 PTBP3 27.661 25 8 42.967 -7.597985386 0.301204819
数据结构样例
字段名 类型 描述 示例 蛋白名称 VARCHAR 标准蛋白符号或暂定编号 TUBA8 Sum PEP Score FLOAT 肽段后验错误概率总和 67.628 Coverage [%] FLOAT 蛋白质序列覆盖率 22 # Peptides INT 鉴定到的唯一肽段数量 8 蛋白组合关联度 FLOAT 基于共表达计算的关联指数 115.495 与均值的差异(得分) FLOAT 相对于样本均值的表达差异 32.36901461 相对覆盖率 FLOAT 标准化后的相对覆盖率值 0.265060241
数据状态
  • 2025-11-15

    数据知识产权登记完成