广东省数据知识产权存证登记平台
登记信息
肠道代谢产物谱与菌群互作数据集 已登记
  • 数据申请号:

    粤2025102702305

  • 数据登记号:

    SZ2025120017715.0

  • 关键词:

    肠道菌群、代谢产物谱、功能基因丰度、肠道生态功能指数、动物健康响应。

  • 登记时间:

    2025-11-11

  • 平台证书编号:

    20251144000017715

  • 数据处理者:

    暂无

  • 服务机构:

    暂无

  • 登记主体:

    清远一生自然生物研究院有限公司

  • 法院编号:

    广州互联网法院 - 42ec0a03e3380de12b2f965b392197206437b43dbdcd06da1c63105b05b21e05-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间:

    2025-11-06

  • 所属区块链:

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹:

    55d0eea3d3e4cec29670245e6d39615830819bdae34ff2ea223ac96bd43e50b4c94ed71e158727a4d68e6c5c7aafdb55b8b57bd6ca66aeb4ebad265bd6c538f7

  • 区块链存证证书编号:

    LXM-GDIPI-23202511063721465467

数据信息
数据简介
该数据集旨在为从事微生物研究、生物发酵及动物健康领域的企业和科研机构提供系统的肠道菌群与代谢产物互作分析数据,用于研究益生菌及其代谢物在维持肠道健康、抑制有害菌生长和改善腹泻等方面的作用。数据内容覆盖多层次的生物学与代谢信息,具体包括:样本编号,用于唯一标识每个实验样本;实验批次号,用于区分不同实验阶段;动物种类或模型类型,用于说明样本来源;取样部位,用于表示采集的肠道部位;处理组别,用于区分对照组与试验组;主要菌群丰度特征,用于记录主要菌属的相对含量;菌群多样性指数,用于评估菌群结构的复杂程度;关键代谢通路名称,用于表征主要代谢类型;代谢产物名称与代谢产物浓度,用于描述和量化代谢特征;菌群与代谢产物相关系数,用于反映两者之间的相关性;功能基因丰度,用于记录与代谢通路相关的基因活性水平;肠道屏障指标摘要与动物健康响应指标,用于综合评价肠道屏障功能和机体健康状态;肠道生态功能指数,通过整合菌群结构、代谢物特征和健康指标计算得到,用于反映肠道生态系统的整体功能水平。
  • 数据来源:

    自行产生

  • 数据所属行业分类:

    M73 研究和试验发展

数据处理规则说明
首先,在原始数据整理阶段,对实验获得的菌群丰度、代谢产物浓度等基础数据进行统一整理和核对,删除重复样本,剔除缺失主要信息或存在明显异常的记录,对不同实验批次的数据进行单位换算和格式统一,确保数据来源一致、内容完整。其次,在实质性加工阶段,使用 Python 数据处理工具(包括 pandas、numpy、scikit-learn 等库)和 R 语言统计分析软件(包括 vegan、psych 等包)对整理后的数据进行分析。通过皮尔逊相关分析计算菌群丰度与代谢产物浓度之间的相关系数,建立菌群与代谢产物的互作关系矩阵;利用主成分分析方法提取菌群结构和代谢特征的主要成分;对健康响应和肠道屏障指标进行归一化处理,并采用加权计算形成综合健康评分。通过上述算法模型的综合应用,实现了对多维实验数据的特征提取和结构化整合。最后,生成创新性数据字段“肠道生态功能指数”,该字段在综合考虑菌群多样性、代谢通路活性、功能基因丰度以及健康响应指标的基础上计算得出,用于反映肠道生态系统的整体功能水平。该创新性字段位于数据文件的第一个工作表中第十五列,列名为“肠道生态功能指数”。
应用场景描述
该数据集可应用于动物营养与肠道健康研究、益生菌产品开发、饲料配方优化、发酵工艺改进以及功能性食品研究等方面。通过该数据集,科研人员和企业可以分析不同益生菌菌群的代谢特征及其与肠道健康之间的关系,为筛选高效菌株、设计复合菌制剂和优化发酵条件提供可靠的数据依据。在动物健康管理领域,该数据集可用于建立菌群与健康状态的关联模型,为降低腹泻发生率和提高免疫功能提供科学参考。在功能性饲料和食品开发中,该数据集能够帮助评价添加剂、发酵原料和代谢物的作用效果,为产品改进与质量控制提供支撑。同时,该数据集还可为高校和科研机构开展肠道微生态机制研究、益生菌功能验证以及代谢调控策略制定提供基础数据支持。
  • 数据格式:

    xlsx

  • 数据更新频率:

    月更新

  • 数据量:

    2025

样例数据
样本编号:S0001;实验批次号:B2024-01;动物种类/模型类型:小鼠;取样部位:盲肠;处理组别:代谢物补充组;主要菌群丰度特征(Top3):毛螺菌19.1%、双歧杆菌15.5%、肠球菌13.4%;菌群多样性指数(Shannon):3.87;关键代谢通路名称:色氨酸代谢通路;代谢产物名称:丁酸盐;代谢产物浓度(μmol/L):24.2;菌群与代谢产物相关系数(r):0.71;功能基因丰度(相对值):ldhA基因:0.88;肠道屏障指标摘要:DAO 12.5 U/L,ZO-1下调;动物健康响应指标:腹泻率2%;肠道生态功能指数:0.8。 附件下载
数据结构样例
肠道代谢产物谱与菌群互作数据集存储于excel表中,数据表字段包含:样本编号(Sample_ID)、实验批次号(Batch_No)、动物种类或模型类型(Animal_Type)、取样部位(Sampling_Site)、处理组别(Treatment_Group)、主要菌群丰度特征(Dominant_Microbes)、菌群多样性指数(Diversity_Index)、关键代谢通路名称(Metabolic_Pathway)、代谢产物名称(Metabolite_Name)、代谢产物浓度(Metabolite_Concentration)、菌群与代谢产物相关系数(Correlation_Coefficient)、功能基因丰度(Functional_Gene_Abundance)、肠道屏障指标摘要(Barrier_Indicators)、动物健康响应指标(Health_Response_Index)、肠道生态功能指数(Gut_Ecological_Function_Index)。
数据状态
  • 2025-11-11

    数据知识产权登记完成