本数据集来源于“6个菌真核转录组技术服务”项目，旨在分析基因表达差异。数据通过真核转录组测序技术获取，经过生物信息学处理（包括质量控制、序列比对、基因定量和差异表达分析），生成基因表达变化统计指标（如log2FoldChange、pvalue、padj），以识别在Doramectin vs DMSO条件下的显著差异表达基因。数据应用场景包括生物医学研究、药物响应机制分析、疾病标记物发现，以及微生物或真核生物的功能基因组学研究，支持药物开发、精准医疗和生物标记物筛选。

1.数据清洗移除低质量序列（Q<30），使用FastQC评估质量。过滤低表达基因（CPM<1）。2.表达量标准化使用TPM或RPKM标准化表达量。TPM公式：TPM_g=(Reads_g/Length_g)*(10^6/Σ(Reads_i/Length_i))。RPKM公式：RPKM_g=(Reads_g*10^9)/(Total_mapped_reads*Length_g)。3.差异表达分析使用DESeq2或edgeR比较组间差异。4.关键输出值计算log2FoldChange(log2FC)：log2FC_g=log2(Mean_Expression_Doramectin_g/Mean_Expression_DMSO_g)。p-value：使用统计检验计算原始显著性。padj(Adjustedp-value)：使用Benjamini-Hochberg方法校正。padj(i)=min((m*p(i))/rank(i),1)。5.基因映射：将标准基因名称映射为临时ID。6.质量控制：使用FASTQC和MultiQC进行质量评估。7.输出格式：结果以结构化Excel表格存储。

1、生物医学研究：用于识别Doramectin药物处理的响应基因，支持药物作用机制解析。 2、药物开发：筛选潜在药物靶点（如显著差异表达基因），加速新药研发流程。 3、疾病诊断：应用于感染性疾病或癌症研究，通过基因表达模式识别生物标记物。 4、微生物学研究：分析6个菌真核转录组，揭示病原体-宿主互作机制。 ​精准医疗：为个体化治疗提供基因表达数据支持，如预测患者对Doramectin的响应。

序号 映射名称 Doramectin_vs_DMSO.log2FoldChange Doramectin_vs_DMSO.pvalue Doramectin_vs_DMSO.padj 1 gene0001 4.64356 2.29623E-05 0.001135742 2 gene0002 4.52386 4.95961E-05 0.002038363 3 gene0003 4.0035 0.000884859 0.018117735

字段名 描述 序号 基因的唯一序号，范围1-1088，用于标识基因顺序。 映射名称 基因的临时映射ID，用于关联基因名称映射表。 Doramectin_vs_DMSO.log2FoldChange Doramectin相对于DMSO的log2倍数变化值，表示基因表达上调（正数）或下调（负数） Doramectin_vs_DMSO.pvalue 差异表达的原始p值，范围0-1，值越小表示差异越显著。 Doramectin_vs_DMSO.padj Benjamini-Hochberg校正后的p值，用于控制多重检验错误率，显著性阈值通常为<0.05。