广东省数据知识产权存证登记平台
退出
登记信息
广东海洋大学对虾测序数据指标综合评分数据集 已登记
  • 数据申请号：

    粤2025111402538

  • 数据登记号：

    SZ2025220020636.8

  • 关键词：

    对虾、基因组重、育种

  • 登记时间：

    2025-12-02

  • 平台证书编号：

    20251144000020636

  • 数据处理者：

    暂无

  • 服务机构：

    广东海洋大学

  • 登记主体：

    广东海洋大学

  • 法院编号：

    广州互联网法院 - 44482d8c41674aeae4d1cced0c709c7282c116033f10c89dcc35acf5e64fbffa-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间：

    2025-11-14

  • 所属区块链：

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹：

    f7abbc0c61d95d46d27228c09c48a4524fd148516cb435f3f3db63e3ae7cba14e5d7fde98cbe2155aaa1f22f4d9866222e043ff377cd69f82c0d16f64c1a5f44

  • 区块链存证证书编号：

    LXM-GDIPI-23202511146203191308

数据信息
数据简介
本数据集源自广东海洋大学凡纳滨对虾基因组重测序实验，包含对547尾凡纳滨对虾进行重测序后的数据，进一步整合了重测序深度、数据利用率等衍生指标，并计算了数据指标综合得分。数据经标准化清洗、质量校验、存储、分析后形成结构化数据集，可用于育种群体性能评估、测序实验质量监控、变异检测可靠性分析、数据标准化比较、基因组研究数据筛选等应用场景的结构化数据。
  • 数据来源：

    协议取得

  • 数据所属行业分类：

    M73 研究和试验发展

数据处理规则说明
1、数据清洗与标准化 (1) 完整性校验： 必填字段：重测序数据深度、重测序数据Rawreads、Cleanreads、比对reads 、变异检出率 (2) 数据标准化： 数据利用率：Clean reads / Raw reads 比对成功率：比对reads / Clean reads 2、数据质量校验 (1) 逻辑关系验证： 数据利用率≤1；比对成功率≤1；变异检出率≤1。 3、数据存储管理 原始测序数据和分析结果数据存储在科研实验数据库 4、数据处理 数据利用率：重测序数据Cleanreads与重测序数据Rawreads的比值，反映数据经过质控后保留的比例。 比对成功率：重测序数据比对reads与重测序数据Cleanreads的比值，体现比对成功的效率。 重测序数据深度的标准化值：（原始值-最小值）/（最大值-最小值） 数据指标综合得分：通过对各项指标进行加权计算得到综合得分，这里简单假设各项指标权重相同。计算公式为：(重测序数据深度的标准化值+数据利用率+比对成功率+重测序数据变异检出率)/4。
应用场景描述
1、育种群体性能评估：基于数据指标综合得分，筛选测序数据质量优良的个体，为亲本选配和高遗传增益群体构建提供数据支撑。 2、测序实验质量监控：通过深度、数据利用率、比对成功率等指标，量化评估测序实验方案的稳定性与可靠性，优化实验流程。 3、变异检测可靠性分析：结合变异检出率与数据质量指标，评估变异检测结果的置信度，提升遗传标记筛选的准确性。 3、数据标准化比较：利用标准化后的深度和综合得分，实现不同批次、不同实验条件下测序数据的跨样本一致性比较。 4、基因组研究数据筛选：为全基因组关联分析（GWAS）、群体遗传学等研究提供高质量数据源，降低技术噪声对分析结果的干扰。
  • 数据格式：

    xlsx

  • 数据更新频率：

    其他

  • 数据量：

    547

样例数据
序号 重测序数据深度 重测序数据Rawreads 重测序数据Cleanreads 重测序数据比对reads 重测序数据变异检出率 数据利用率 比对成功率 重测序数据深度_标准化 数据指标综合得分 3-1 10.5 137712680 135129474 129312037 0.8745 0.981242061 0.956949163 0.136013687 0.737176228 3-2 10.13 133333684 130476470 124711718 0.8697 0.978570951 0.955817689 0.120188195 0.731069209 3-3 11.24 146881962 145107218 138009487 0.8798 0.987917209 0.9510863 0.167664671 0.746617045
数据结构样例
字段名称 数据类型 字段描述 示例值 序号 String 样本唯一标识编号 3-1 重测序数据深度 Float 测序覆盖深度指标 10.5 重测序数据Rawreads Integer 原始测序产生的reads数量 137712680 重测序数据Cleanreads Integer 质控后有效reads数量 135129474 重测序数据比对reads Integer 成功比对到参考基因组的reads数量 129312037 重测序数据变异检出率 Float 变异位点检出比例 0.8745 数据利用率 Float Clean reads与Raw reads的比值 0.981242061 比对成功率 Float 比对reads与Clean reads的比值 0.956949163 重测序数据深度_标准化 Float 归一化处理后的深度指标 0.136013687 数据指标综合得分 Float 多指标集成评价分数(0-1) 0.737176228
数据状态
  • 2025-12-02

    数据知识产权登记完成

管理单位：广东省市场监督管理局（知识产权局）

登记机构：广东省知识产权保护中心

网站备案号：粤ICP备19045762号

技术支持：020-31605060，020-31608654