广东省数据知识产权存证登记平台-证书详情

登记信息

广东海洋大学凡纳滨对虾变异检出数据集 已登记

数据申请号：

粤2025111402539
数据登记号：

SZ2025220020637.9
关键词：

凡纳滨对虾、基因组重、基因型分型
登记时间：

2025-12-02
平台证书编号：

20251144000020637
数据处理者：

暂无
服务机构：

广东海洋大学
登记主体：

广东海洋大学
法院编号：

广州互联网法院 - 11a65cdda58f0cba2939a8e20da2cf8823517930eb90b73f45e4751ed52803aa-749fc1a4;legalxchain

区块链信息

上链时间：

2025-11-14
所属区块链：

司法联盟链·广东省知识产权保护中心
证据指纹：

a66695dc238f9e0690ca18e919f6f4d92b5cffc794bc730ba5086e5a489be1571f2782c720302250847891a1382cd00f4b2608055fc76aae0bec152a691c7f02
区块链存证证书编号：

LXM-GDIPI-23202511146208839823

数据信息

数据简介

本数据集源自广东海洋大学凡纳滨对虾基因组重测序实验，包含使用凡纳滨对虾50K基因芯片对420尾对虾进行基因型分型的数据。数据经标准化清洗、质量校验、存储、分析后形成结构化数据集，可用于遗传变异分析、育种优化、种群多样性研究等应用场景。

数据来源：

协议取得
数据所属行业分类：

M73 研究和试验发展

数据处理规则说明

1、数据清洗与标准化 (1) 完整性校验：必填字段：样本编号、重测序数据Raw reads、Clean reads、比对reads、变异检出率 (2) 数据标准化：数据过滤比例统一计算为Clean reads/Raw reads 比对成功率统一计算为比对reads/Clean reads 2、数据质量校验 (1) 逻辑关系验证：数据过滤比例≤1；比对成功率≤1。 3、数据存储管理原始测序数据和分析结果数据存储在科研实验数据库 4、数据处理数据过滤比例：重测序数据Cleanreads与重测序数据Rawreads的比例，反映数据过滤的程度。比对成功率：重测序数据比对reads与重测序数据Cleanreads的比例，体现数据比对的效率。变异检出情况分类：根据重测序数据变异检出率进行分类，例如高变异（检出率大于0.985）、中变异（0.98至0.985之间）、低变异（小于0.98），有助于快速识别变异水平。

应用场景描述

1、遗传变异分析：基于变异检出率与分类，识别对虾重要经济性状相关SNP标记。 2、育种优化：通过比对成功率与变异情况，指导亲本选配和遗传增益评估。 3、种群多样性研究：利用reads数据量化遗传距离，解析群体结构。

数据格式：

xlsx
数据更新频率：

其他
数据量：

420

样例数据

序号重测序数据Rawreads 重测序数据Cleanreads 重测序数据比对reads 重测序数据变异检出率数据过滤比例比对成功率变异检出情况分类 10 19357950 19181938 19140586 0.984 0.990907508 0.997844222 中变异 14 19300272 19166588 19138272 0.9853 0.993073465 0.998522637 高变异 15 20205526 20015198 19987946 0.9836 0.990580399 0.998638435 中变异

数据结构样例

字段名称数据类型字段描述示例值序号 Integer 数据记录唯一标识 10 重测序数据Rawreads Integer 原始测序产生的reads数量 19357950 重测序数据Cleanreads Integer 经过质量控制和过滤后的有效reads数量 19181938 重测序数据比对reads Integer 成功比对到参考基因组的reads数量 19140586 重测序数据变异检出率 Float 变异位点检出比例 0.984 数据过滤比例 Float Clean reads与Raw reads的比值 0.990907508 比对成功率 Float 比对reads与Clean reads的比值 0.997844222 变异检出情况分类 String 基于变异检出率的分类：高/中/低变异中变异

数据状态

2025-12-02

数据知识产权登记完成