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登记信息
佛山大学基于circ-SHPRH编码的治疗性SHPRH-146aa对神经母细胞瘤中的CDKs数据集 已登记
  • 数据申请号：

    粤2025111102509

  • 数据登记号：

    SZ2025320022063.5

  • 关键词：

    CDK基因分析、调控机制、靶向治疗分析

  • 登记时间：

    2025-12-13

  • 平台证书编号：

    20251144000022063

  • 数据处理者：

    暂无

  • 服务机构：

    佛山大学

  • 登记主体：

    佛山大学

  • 法院编号：

    广州互联网法院 - f67676c74851fe0958ce88d53073347cfc3a5a81f9cb4ff34664784693a4ce3c-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间：

    2025-11-18

  • 所属区块链：

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹：

    1ebac2bce4a49ed9a38c17d8fb4884171bba412cd326df684bd516ef48dfeca6de78caa7581817eeb646b0d256fab59ee80c341494f2683cdf63425b59620799

  • 区块链存证证书编号：

    LXM-GDIPI-23202512304044799139

数据信息
数据简介
本数据集核心内容为佛山大学基于公共数据库资源进行二次计算和整合的基因表达数据。数据来源于美国国立生物技术信息中心（NCBI）的基因表达综合数据库（GEO）的公开数据集（登录号：GSE244294），该数据集包含了circ-SHPRH编码的SHPRH-146aa对神经母细胞瘤细胞作用的原始测序数据。本数据集对该原始数据进行了规范的生物信息学处理，计算了特定基因集的FPKM表达量及其统计指标（标准差、变异系数）。其主要应用场景集中于生物医药领域的神经母细胞瘤发病机制研究、治疗性肽段的药物靶点筛选与验证，为后续的临床前研究提供数据支持。
  • 数据来源：

    公开采集

  • 数据所属行业分类：

    M73 研究和试验发展

数据处理规则说明
本数据集通过对GSE244294原始测序数据的处理，生成基因表达水平数据，并进行统计汇总。具体处理流程与计算规则如下： ​平均表达量​ ​计算公式​：平均表达量 = (S_OE_Cs_1_fpkm + S_OE_Cs_2_fpkm + S_OE_Cs_3_fpkm) / 3，此值为算术平均值，代表该基因在三个生物学重复中的平均表达水平。 ​表达量标准差​计算公式​：表达量标准差 = SQRT( ( (S_OE_Cs_1_fpkm - 平均表达量)^2 + (S_OE_Cs_2_fpkm - 平均表达量)^2 + (S_OE_Cs_3_fpkm - 平均表达量)^2 ) / (3 - 1) )，此值为样本标准差，衡量三个重复样本FPKM值相对于其平均值的离散程度。 ​变异系数​计算公式​：变异系数 = 表达量标准差 / 平均表达量，此值为变异系数，用于消除单位和平均值不同对数据离散程度比较的影响，评估基因表达水平的稳定性或实验重复性。
应用场景描述
肿瘤生物学机制研究​：用于分析SHPRH-146aa对神经母细胞瘤细胞基因表达谱的影响，特别是对细胞周期相关激酶（CDKs）通路的调控作用研究。 ​药物靶点发现与验证​：通过差异表达分析和表达稳定性评估，筛选出对治疗干预响应显著且可靠的潜在生物标志物或药物作用新靶点。 ​科学研究与学术交流​：作为深入探索circRNA及功能肽段在癌症中作用的重要数据基础，可用于学术论文发表、科研项目申请及学术会议报告。 ​后续开发数据支撑​：为基于SHPRH-146aa的神经母细胞瘤治疗策略的进一步优化和临床前开发提供关键的数据依据。
  • 数据格式：

    xlsx

  • 数据更新频率：

    其他

  • 数据量：

    50

样例数据
序号 基因名称 S_OE_Cs_1_fpkm S_OE_Cs_2_fpkm S_OE_Cs_3_fpkm 细胞类型 病毒名称 平均表达量 表达量标准差 变异系数 1 AL354707.2 0.138076972 0.907404143 0.56223244 肿瘤细胞 腺病毒 0.535904518 0.385338739 0.719043646 2 RNU4ATAC 0.917613894 0 4.203462219 肿瘤细胞 腺病毒 1.707025371 2.210124774 1.294722862 3 GP6 0.043113934 0.094444333 0.087777318 肿瘤细胞 腺病毒 0.075111862 0.027910801 0.371589786
数据结构样例
序号 字段名称 数据类型 字段描述与说明 1 序号 整数 数据记录的唯一序列标识。 2 基因名称 文本 标准基因标识符，来源于对GSE244294数据比对注释后得到的基因符号（如AL354707.2）。 3 S_OE_Cs_1_fpkm 数值 对GSE244294中样本1数据计算得到的基因表达量（FPKM值）。 4 S_OE_Cs_2_fpkm 数值 对GSE244294中样本2数据计算得到的基因表达量（FPKM值）。 5 S_OE_Cs_3_fpkm 数值 对GSE244294中样本3数据计算得到的基因表达量（FPKM值）。 6 细胞类型 文本 原始数据对应的细胞类型，本数据集统一为“肿瘤细胞”（神经母细胞瘤细胞）。 7 病毒名称 文本 原始实验中使用的基因操作载体，本数据集统一为“腺病毒”。 8 平均表达量 数值 根据规则3.2.1计算得出的三个样本FPKM值的算术平均值。 9 表达量标准差 数值 根据规则3.2.2计算得出的三个样本FPKM值的样本标准差。 10 变异系数 数值 根据规则3.2.3计算得出的表达量标准差与平均表达量的比值。
数据状态
  • 2025-12-13

    数据知识产权登记完成

管理单位：广东省市场监督管理局（知识产权局）

登记机构：广东省知识产权保护中心

网站备案号：粤ICP备19045762号

技术支持：020-31605060，020-31608654