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登记信息
佛山大学基于Hsp90抑制剂(Hsp90i)治疗后HIV感染儿童扁桃体单个核细胞后的基因表达变化数据集 已登记
  • 数据申请号:

    粤2025111102499

  • 数据登记号:

    SZ2025320022066.8

  • 关键词:

    Hsp90抑制剂​(包括缩写Hsp90i);HIV感染儿童​;​扁桃体单个核细胞​;​基因表达变化

  • 登记时间:

    2025-12-13

  • 平台证书编号:

    20251144000022066

  • 服务机构:

    佛山大学

  • 登记主体:

    佛山大学

  • 法院编号:

    广州互联网法院 - 15e7618fbd086cc5422f9a45383ce69102bc26b110766ba17f322b6f54880313-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间:

    2025-11-18

  • 所属区块链:

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹:

    f08deb7091e4ba9fd55e69ae7c29a907dd263e085556d58686ae48f82e3acb6a955ed604dac0d08a799a794c04d6ed58b5ab1c0d0dcb05ba3b27a6fd448589d4

  • 区块链存证证书编号:

    LXM-GDIPI-23202512303944286789

数据信息
数据简介
本数据集由佛山大学基于美国国家生物技术信息中心(NCBI)公共数据库获取的原始数据,经研究团队对HIV感染儿童扁桃体单个核细胞在Hsp90抑制剂处理后的基因表达数据进行实质性加工处理形成。通过专业的数据清洗、标准化处理、深度分析与挖掘,获得60个显著差异表达基因的完整特征信息。该数据集可应用于HIV治疗机制研究、药物靶点发现及儿童艾滋病精准医疗等科研与临床应用场景。
  • 数据来源:

    公开采集

  • 数据所属行业分类:

    M73 研究和试验发展

数据处理规则说明
数据提取与标准化整合:从NCBI的GeneExpressionOmnibus(GEO)数据库(数据库登录号:GSE178178)提取关键数据字段,确保每个观测记录对应一个特定基因在实验条件下的表达信息。 数据清洗与质量控制:对提取的数据进行质量控制,识别并处理潜在的异常值或缺失值。 数据字段规范化:基因注释与类型统一:将基因功能统一规范为"蛋白质编码基因"、"长链非编码RNA"、"假基因"、"snoRNA"等标准术语。实验条件标准化:将细胞来源统一描述为"小儿扁桃体单核细胞",病毒信息统一为"艾滋病病毒"及其属"慢病毒属"。变化方向明确化:将基因表达变化统一规范为"上调"。显著性分级:根据统计学阈值,对显著性进行分级为"极显著"。 3.衍生字段计算公式说明: 表达变化倍数=2^差异表达变化程度 调节效应强度=-log10(显著性)×差异表达变化程度 4.质量评估标准: 显著性等级划分:p-value<0.01为"极显著" 数据完整性检查:确保所有字段无缺失值
应用场景描述
1.科学研究:HIV感染分子机制研究、Hsp90抑制剂作用机理探索 2.药物开发:抗HIV药物靶点筛选与验证、联合用药方案优化 3.临床医学:儿童艾滋病个体化治疗策略制定、疗效预测 4.生物标志物:HIV治疗响应预测标志物识别与验证 5.学术交流:病毒-宿主相互作用机制研究的共享数据资源
  • 数据格式:

    xlsx

  • 数据更新频率:

    其他

  • 数据量:

    60

样例数据
序号 基因名称 差异表达变化程度 显著性 显著性的可靠性 细胞类型 病毒名称 病毒分类(属) 基因注释 调节方向 显著性等级 是否编码蛋白 表达变化倍数 调节效应强度 1 S100A14 6.949611428 7.45701E-37 2.77989E-35 小儿扁桃体单核细胞 艾滋病病毒 慢病毒属 蛋白质编码基因 上调 极显著 是 123.6065538 251.0716355 2 CRHR1 5.824063424 2.68088E-13 2.36213E-12 小儿扁桃体单核细胞 艾滋病病毒 慢病毒属 蛋白质编码基因 上调 极显著 是 56.65233143 73.21850548 3 CDH3 4.977415157 3.86246E-27 9.50648E-26 小儿扁桃体单核细胞 艾滋病病毒 慢病毒属 蛋白质编码基因 上调 极显著 是 31.50295284 131.4691424
数据结构样例
字段名称 数据类型 描述说明 计量单位 序号 整型 基因记录编号 无 基因名称 文本 标准基因符号或编号 无 差异表达变化程度 浮点型 log2转换的表达变化值 log2(倍数) 显著性 浮点型 差异表达统计学p-value 无 显著性的可靠性 浮点型 校正后的显著性值 无 细胞类型 文本 实验所用细胞类型 无 病毒名称 文本 感染病毒种类 无 病毒分类(属) 文本 病毒属级分类 无 基因注释 文本 基因功能分类注释 无 调节方向 文本 表达变化方向 无 显著性等级 文本 显著性程度分级 无 是否编码蛋白 布尔 蛋白质编码基因判断 无 表达变化倍数 浮点型 实际表达变化倍数 倍数 调节效应强度 浮点型 综合调节效应指标 无
数据状态
  • 2025-12-13

    数据知识产权登记完成