本数据集命名为“佛山大学基于SRPK1与HRV感染互作转录组数据的相互关系研究数据集”。数据集源自国际公共数据库NCBI GEO（登录号：GSE203428）中关于人鼻病毒A型（HRV16）感染原代支气管上皮细胞的原始转录组测序数据。佛山大学通过对原始数据进行下载、标准化处理、差异表达分析、基因功能注释等实质性加工，系统地筛选并鉴定了在HRV感染背景下与SRPK1基因功能相互作用相关的关键差异表达基因及其特征。本数据集可应用于呼吸道病毒感染机制、先天免疫应答、宿主与病毒相互作用等领域的深度挖掘和生物信息学分析，为相关药物靶点发现和疾病生物标志物研究提供高质量的数据支持。

1.数据清洗与标准化：对原始表达量数据进行质量控，去除低质量或低表达的基因，并使用如TPM或FPKM等方法进行标准化，以消除测序深度和基因长度带来的偏差。 2.差异表达分析： 方法：采用生物信息学软件进行差异表达分析。 计算：差异表达变化程度（如Log2 Fold Change）和统计显著性（FDR p-value）计算公式基于广义线性模型，比较病毒感染组（HRV-A mean）与对照组（Ctrs mean）的表达水平。 显著性阈值：设定显著差异表达基因的阈值，通常为|差异表达变化程度|>1（即表达量翻倍或减半）且FDR p-value < 0.05。 3.基因信息整合与注释： 基于基因名称，从权威数据库批量获取并整合每个基因的详细信息，包括物种来源、细胞遗传学定位和基因注释（功能描述），将抽象的基因标识符转化为具有明确生物学意义的结构化信息。基于图谱的映射，使用NCBI的genome2cytoband工具定位基因组坐标并进行标注。 4.数据筛选与重构：根据研究主题，从全基因组分析结果中筛选出最相关的基因子集，并重新组织字段，形成最终的本数据集。

基础科学研究：用于深入探索HRV感染呼吸道上皮细胞的分子机制，特别是先天免疫信号通路（如干扰素通路）的激活规律。 药物靶点发现：数据集中的关键差异表达基因（如DDX58/RIG-I, OAS1, ISG15等）可作为潜在的抗病毒药物研发靶点。 生物标志物开发：筛选出的显著上调或下调基因，有可能作为临床诊断HRV感染严重程度或预测治疗反应的潜在生物标志物。 生物信息学算法验证：可作为新开发的差异表达分析算法或功能注释工具的测试与验证数据集。 多组学数据整合分析：可与蛋白质组学、表观遗传学等其他组学数据整合，进行系统性生物学研究。

序号 基因名称 差异表达变化程度 FDR p-value Ctrs mean HRV-A mean 细胞类型 病毒名称 病毒种属 物种来源 细胞遗传学定位 基因注释 1 CXCL11 7.433892299 2.824E-115 0.083271935 14.15219764 原代支气管上皮细胞 HRV16 人鼻病毒A型 Homo sapiens 4q21.1 γ-干扰素诱导趋化因子IP-9 2 ZBP1 7.175983091 3.4986E-112 0.056526026 7.42397579 原代支气管上皮细胞 HRV16 人鼻病毒A型 Homo sapiens 20q13.2 Z-DNA结合蛋白1（抗病毒先天免疫传感器） 3 CXCL10 6.267632382 9.9032E-167 0.766308919 53.13743144 原代支气管上皮细胞 HRV16 人鼻病毒A型 Homo sapiens 4q21.1 γ-干扰素诱导趋化因子IP-10

字段名称 数据类型 描述 示例 序号 整数 数据记录的唯一序列标识，用于排序和索引 1 ​基因名称 文本 基因的标准官方符号 CXCL11 差异表达变化程度 浮点数 基因在HRV感染组相对于对照组的表达量变化倍数 7.433892299 ​FDR p-value 浮点数 经过错误发现率校正后的显著性p值 2.824E-115 ​Ctrs mean 浮点数 对照组（未感染HRV）中该基因的表达量均值。 0.083271935 ​HRV-A mean 浮点数 HRV16病毒感染组中该基因的表达量均值。 14.15219764 ​细胞类型 文本 进行实验的细胞类型 原代支气管上皮细胞 ​病毒名称 文本 感染所用病毒的名称 HRV16 ​病毒种属 文本 病毒的分类学种属 人鼻病毒A型 ​物种来源 文本 实验样本（细胞）的物种来源 Homo sapiens 细胞遗传学定位 文本 基因在染色体上的具体位置 4q21.1 ​基因注释 文本 对该基因主要生物学功能的简要文字描述，帮助理解基因在病毒感染过程中的潜在作用。 γ-干扰素诱导趋化因子IP-9