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登记信息
佛山大学泰国伯克霍尔德菌生长阶段转换期的转录组谱与差异表达基因分析数据集 已登记
  • 数据申请号:

    粤2025111002481

  • 数据登记号:

    SZ2025320022147.8

  • 关键词:

    ​泰国伯克霍尔德菌​;生长阶段转换期;转录族谱;差异表达

  • 登记时间:

    2025-12-15

  • 平台证书编号:

    20251144000022147

  • 服务机构:

    佛山大学

  • 登记主体:

    佛山大学

  • 法院编号:

    广州互联网法院 - d358965998581f4e95badd376316e678e085d3dfc74b06c023cef74a35bd75a3-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间:

    2025-12-09

  • 所属区块链:

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹:

    01e230bdf5a8cd2cbc9e1ea002bb157661e1e5eb3705a9f5d523fa72a4aa2f8caf1187f384dd4f8ade0eeb25d85d26f27d4384ee83fea0ca95a52e07b4a9c1d4

  • 区块链存证证书编号:

    LXM-GDIPI-23202512095820715198

数据信息
数据简介
本数据集记录了泰国伯克霍尔德菌(Burkholderiathailandensis)在特定实验条件下的基因表达水平,包含基因基础表达量、差异表达分析及功能注释等核心信息。数据源于对公共数据集(登录号:SRP210467)的原始测序数据进行再处理与分析,通过生物信息学流程生成基因表达量化值、差异比较及功能标注等衍生列。适用于基因功能研究、微生物代谢途径分析、生物标记物筛选等生物医药研发场景。
  • 数据来源:

    公开采集

  • 数据所属行业分类:

    M73 研究和试验发展

数据处理规则说明
1.基础字段提取: 基因表达水平基础指标(baseMean,baseMeanA,baseMeanB)直接从公共数据集SRP210467的标准化分析结果中提取。 基因名称(基因标识符)直接引用自公共数据集。 2.衍生字段计算规则: 表达差异绝对值:计算公式为|baseMeanB-baseMeanA|。 表达差异百分比:计算公式为((baseMeanB-baseMeanA)/baseMeanA)*100。 细菌名称、细菌分类(属)、基因注释:通过将基因标识符与专业生物数据库(如NCBIRefSeq、UniProt等)进行比对查询获得。 3.数据清洗规则: 逻辑校验:确保baseMean值符合(baseMeanA+baseMeanB)/2的逻辑关系(允许浮点数计算误差)。 无效记录过滤:删除基因标识符为空或无法匹配到标准注释信息的记录。 4.数值精度处理: 表达差异百分比保留小数点后10位以保持计算精度。其他数值字段根据原始数据精度保留。
应用场景描述
1.微生物基因功能研究:通过差异表达分析,筛选在特定条件下显著上调或下调的基因,用于研究泰国伯克霍尔德菌的代谢通路、致病机制或环境适应性。 2.生物标记物开发:利用高表达差异的基因信息,潜在用于开发该菌种的检测标记物或药物靶点。 3.比较基因组学分析:为本物种或其他相关物种的基因表达研究提供基础数据和比对参考。
  • 数据格式:

    xlsx

  • 数据更新频率:

    其他

  • 数据量:

    60

样例数据
序号 基因名称 baseMean baseMeanA baseMeanB 细菌名称 细菌分类(属) 基因注释 表达差异绝对值 表达差异百分比 1 andAd 11422.3 13.9 22830.6 泰国伯克霍尔德菌 伯克霍尔德菌属 小末端亚基 22816.7 16414892.09% 2 andAc 28360.8 45.4 56676.2 泰国伯克霍尔德菌 伯克霍尔德菌属 氧化酶复合体亚基 56630.8 12473744.49% 3 andAb 4895.7 10.2 9781.2 泰国伯克霍尔德菌 伯克霍尔德菌属 氧化酶复合体亚基 9771 9579411.76%
数据结构样例
字段名 数据类型 描述 示例值 序号 数值 标识符,表示数据记录的序列号 1 基因名称 文本 基因的标准命名或标识符,源自公共数据集SRP210467 andAd baseMean 数值 标准化后的基因表达水平均值,源自公共数据集SRP210467 11422.3 baseMeanA 数值 条件A下的标准化基因表达水平均值,源自公共数据集SRP210467 13.9 baseMeanB 数值 条件B下的标准化基因表达水平均值,源自公共数据集SRP210467 22830.6 细菌名称 文本 通过基因标识符比对衍生标注的细菌物种名称 泰国伯克霍尔德菌 细菌分类(属) 文本 通过基因标识符比对衍生标注的细菌属级分类信息 伯克霍尔德菌属 基因注释 文本 通过基因标识符比对衍生标注的基因功能描述 小末端亚基 表达差异绝对值 数值 条件B与条件A表达水平的绝对差值(计算衍生列) 22816.7 表达差异百分比 数值 条件B相对于条件A表达水平的变化百分比(计算衍生列) 164148.920863309
数据状态
  • 2025-12-15

    数据知识产权登记完成