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登记信息
佛山大学基于IGF2BP3通过m6A修饰调控急性髓系白血病干细胞自我更新与白血病的发生机制的研究数据集 已登记
  • 数据申请号:

    粤2025112402765

  • 数据登记号:

    SZ2025320022352.6

  • 关键词:

    急性髓系白血病;干细胞;白血病发生机制

  • 登记时间:

    2025-12-16

  • 平台证书编号:

    20251244000022352

  • 服务机构:

    佛山大学

  • 登记主体:

    佛山大学

  • 法院编号:

    广州互联网法院 - ca5ae73ab848d2338b0f3887738319f19957ed885a915fa9316ccf2d30fba419-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间:

    2025-12-03

  • 所属区块链:

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹:

    cfd5203919ab19f586ce59b97d1eac63242845ce3f774fc0ba1edbc1e4567db195c5903a96405f448de274ee49ca1ed70fdd0fa3efe538ef9b16598ba529d4a1

  • 区块链存证证书编号:

    LXM-GDIPI-23202512304064005741

数据信息
数据简介
本数据集记录了基于公共基因表达数据(登录号:GSE268082)进行差异表达分析的结果,包含60个基因的基线表达水平、统计显著性、表达变化方向及幅度等核心指标。数据源自对公共数据的深度挖掘与生物信息学分析,通过计算获得表达稳定性指数、调控重要性评分等衍生指标。适用于疾病标志物挖掘、药物靶点发现、基因功能与调控机制研究等生物医学场景。
  • 数据来源:

    公开采集

  • 数据所属行业分类:

    M73 研究和试验发展

数据处理规则说明
衍生字段计算规则 表达变化绝对值:计算公式为ABS(差异表达变化)。用于衡量表达变化的幅度,而不考虑方向(上调/下调)。 -log10(显著性):计算公式为-LOG10(显著性)。将显著性p值转换为正值,便于可视化与阈值筛选(值越大,统计显著性越强)。 表达稳定性指数: 计算基础:该指数为基于整个数据集的全局性指标,非逐行计算。 计算公式:1-(STDEV("basemean"列)/AVERAGE("basemean"列)) 该公式是变异系数(CV)的变形,计算结果用于评估数据集中基因表达水平的整体离散程度。 调控重要性评分: 计算综合评分:归一化的显著性得分*0.5+归一化的变化幅度得分*0.5 最终公式:("-log10(显著性)"/MAX("-log10(显著性)"列))*0.5+("表达变化绝对值"/MAX("表达变化绝对值"列))*0.5 3、数据清洗规则 无效记录过滤:删除关键字段(如基因名称、显著性)为空或为异常值(如显著性>1)的记录。 数值精度处理:所有数值型字段均保留足够有效数字以确保分析精度。
应用场景描述
1、生物标志物发现 通过“显著性”与“差异表达变化”筛选在特定条件(如疾病组vs.对照组)下显著差异表达的基因,作为潜在的诊断或预后标志物。 2、药物靶点研发 利用“调控重要性评分”和“差异表达变化”识别在疾病通路中关键且可调控的基因,为新型药物研发提供候选靶点。 3、功能基因组学研究 结合“baseMean”和“表达稳定性指数”,分析基因表达特性,深入探究基因在生物学过程中的功能与调控机制。
  • 数据格式:

    xlsx

  • 数据更新频率:

    其他

  • 数据量:

    60

样例数据
序号 基因名称 basemean 显著性 差异表达变化 表达稳定性指数 -log10(显著性) 表达变化绝对值 调控重要性评分 1 AVPR2 38.17903434 0.000841841 1.946612781 0.014441299 3.074769922 0.946612781 0.513412821 2 ATP2B2 51.51555798 0.00011869 1.892099937 0.02346399 3.925584684 0.892099937 0.488330627 3 HMOX1 86.18876246 1.95664E-07 1.891606335 0.046921797 6.708488289 0.891606335 0.500209544
数据结构样例
数据结构说明 字段名 数据类型 描述 示例值 基因名称 文本 基因的标准命名或Ensembl基因编号 AVPR2 baseMean 数值 该基因在所有样本中标准化后的平均表达量 38.179 显著性 数值 差异表达分析的统计检验p值或校正后p值 0.00084 差异表达变化 数值 以对数比(log2FoldChange)表示的表达量变化程度与方向 1.9466 表达稳定性指数 数值 评估基因表达稳定性的指标,值越低越稳定 0.0144 -log10(显著性) 数值 显著性指标的负对数转换值,便于分析 3.0748 表达变化绝对值 数值 “差异表达变化”以1为基准的绝对值,反映变化幅度 0.9466 调控重要性评分 数值 综合多项指标评估基因调控重要性的复合评分 0.5134
数据状态
  • 2025-12-16

    数据知识产权登记完成