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登记信息
佛山大学基于E2F1敲降后EBV阳性P3HR1细胞中宿主与病毒基因表达动态变化的研究数据集 已登记
  • 数据申请号:

    粤2025112402764

  • 数据登记号:

    SZ2025320022922.9

  • 关键词:

    E2F1转录因子;EBV病毒;宿主细胞基因;基因表达;敲降实验

  • 登记时间:

    2025-12-20

  • 平台证书编号:

    20251244000022922

  • 服务机构:

    佛山大学

  • 登记主体:

    佛山大学

  • 法院编号:

    广州互联网法院 - 6195338ca230cb6f2809494aeba9a8ea3af68e60245b4501d2b9fbee91baa821-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间:

    2025-12-15

  • 所属区块链:

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹:

    b8d7773abbd3f26863a2a1ddd137b9188db4260917f84d9abfa83f762f4faa2a11f9af5badc345d4b0fa11446357c3700af9311b5f39877bd58f72bf4347549f

  • 区块链存证证书编号:

    LXM-GDIPI-23202512155636346070

数据信息
数据简介
本数据集的核心原始数据源自国际权威的基因表达数据库——美国国家生物技术信息中心(NCBI)旗下的GEO(Gene Expression Omnibus)。数据为数据库中(如E2F1基因敲降的EBV阳性细胞模型)基因表达谱,包含基因名称、显著性、差异表达变化、显著性的可靠性等关键指标。佛山大学研究团队以此原始数据为基础,进行了深入的实质性加工与整合分析(包括数据清洗、标准化、功能注释及与自有实验元数据的关联),最终形成了本登记数据集。其核心应用场景聚焦于病毒感染机制、肿瘤生物学、生物标志物发现等生物医学前沿领域的研究与开发。
  • 数据来源:

    公开采集

  • 数据所属行业分类:

    M73 研究和试验发展

数据处理规则说明
数据清洗与整合:对GEO来源的数据进行质量控制,剔除无效或低质量数据点,并将其与团队自有实验产生的元数据(如细胞类型、细胞系、病毒信息等)进行精准关联与整合。深度分析与字段衍生:基于原始“显著性”和“差异表达变化”字段,应用专业的统计学和生物学知识,创建了新的衍生字段,如“显著性等级”(如:极显著、不显著)、“表达变化方向”(上调/下调)、“表达变化幅度”(大幅/中度/小幅)等。这些新字段是原始数据所不具备的、具有高附加值的知识成果。基因功能注释: 对数据集中的基因进行了系统的功能注释,增加了“基因注释”字段,极大地提升了数据的易用性和科学价值。 1.显著性等级划分规则: 极显著(p2(即Fold Change绝对值大于4倍) 中度变化:1≤|差异表达变化|≤2 小幅变化:|差异表达变化|0 下调:差异表达变化<0
应用场景描述
1.基础科学研究:用于研究E2F1转录因子在EBV感染及潜伏过程中的调控网络,特别是其对宿主细胞基因和病毒基因表达的影响。 2.肿瘤生物学研究:深入理解EBV相关Burkitt淋巴瘤的发病机制,寻找关键的致病基因和信号通路。 3.免疫学研究:分析病毒如何通过调控宿主基因(如ULBP2,一种NK细胞激活配体)来逃避免疫监视。 4.药物靶点筛选:鉴定在E2F1敲降后发生显著变化的基因,作为潜在的抗病毒或抗肿瘤治疗靶点。 5.生物标志物开发:筛选具有显著表达差异的基因,作为疾病诊断或预后评估的潜在分子标志物。
  • 数据格式:

    xlsx

  • 数据更新频率:

    其他

  • 数据量:

    60

样例数据
详见附件 附件下载
数据结构样例
序号字段名称数据类型描述说明1序号整数数据记录的唯一编号。2基因名称字符串标准化的基因符号或名称。3显著性(P值)浮点数差异表达分析的原始统计检验P值,数值越小表明差异越显著。4差异表达变化浮点数基因表达量变化的对数值(如log2(FoldChange)),正值表示上调,负值表示下调。5显著性的可靠性浮点数可能为校正后的P值(如FDR)或其他可靠性指标,数值越小越可靠。6细胞类型字符串实验所用细胞的来源组织类型。7细胞系字符串实验所使用的特定细胞系名称。8病毒名称字符串细胞系中携带的病毒名称。9病毒属字符串病毒所属的分类学属。10基因注释字符串对该基因已知或预测功能的简要生物学描述。11表达变化方向字符串根据“差异表达变化”值自动判定的方向,分为“上调”或“下调”。12显著性等级字符串根据P值划分的显著性等级,如“极显著(p2)”。13表达变化幅度字符串根据“差异表达变化”绝对值划分的变化程度,如“大幅变化(>2)”。
数据状态
  • 2025-12-20

    数据知识产权登记完成