广东省数据知识产权存证登记平台
登记信息
益生菌菌株代谢性能与通路关联整合数据集 已登记
  • 数据申请号:

    粤2026080705264

  • 数据登记号:

    SZ2026120008167.2

  • 关键词:

    益生菌、代谢产物谱、通路通量、性能关联、数据标准化

  • 登记时间:

    2026-09-09

  • 平台证书编号:

    20260844000008167

  • 数据处理者:

    暂无

  • 服务机构:

    暂无

  • 登记主体:

    广东容大生物股份有限公司

  • 法院编号:

    广州互联网法院 - 5b08eea7768b6919580188c9f1edc280e36cb957adf17d84801ff22c9340f238-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间:

    2026-09-01

  • 所属区块链:

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹:

    b9223b28ea5b4e74b9f3188e4e901855565d2e01bf1754ae0f1770a832a0e83dd080b436f6ba1657790c857f8002693be77990bd8315918b7a5c8756b6c8036f

  • 区块链存证证书编号:

    LXM-GDIPI-23202609015691265190

数据信息
数据简介
本数据集是针对益生菌功能开发与代谢优化场景,基于实验室2024-2025年菌株性能检测、代谢产物谱分析、代谢通路通量检测的原始实验数据,通过数据清洗、两表关联、标准化加工形成的结构化数据集。数据集覆盖地衣芽孢杆菌、嗜冷乳杆菌、副干酪乳杆菌等20余种常用益生菌株,涵盖菌株基础信息、培养条件、性能指标、代谢产物特征、性能关联分析、代谢通路通量、基因表达特征等28个核心字段。该数据集建立了代谢产物-菌株性能-通路通量的关联规则,解决了原始实验数据分散、关联度低、评价标准不统一的问题,实现了从菌株性能到分子层面代谢通路的全链路关联,为益生菌功能筛选、发酵条件优化、代谢工程改造提供高质量数据支撑。
  • 数据来源:

    自行产生

  • 数据所属行业分类:

    C14 食品制造业

数据处理规则说明
1. 数据清洗:以数据编号为唯一标识去重,检查所有字段无空值;对所有数值指标做范围校验,剔除超出合理区间的异常值;统一所有分类字段的标准取值,不允许自定义内容。 2. 两表关联整合:以数据编号为唯一关联键,将菌株代谢产物-性能关联数据与代谢通路通量数据一一关联,形成从菌株性能到代谢通路的完整数据记录,保留全部原始字段不删除。 3. 核心指标加工: (1)综合关联评分:根据代谢产物与菌株性能的关联系数绝对值、统计显著性p值计算评分,|r|越接近1、p值越小评分越高,p<0.05标记为显著关联,评分范围5-95分; (2)功能关联结论:按统一格式自动生成,标准化标注相关方向与显著性; (3)综合代谢性能评分:结合通路类型、关键酶、能量利用方式、基因表达特征4个维度综合评级,70-99分,分数越高等路整体性能越好。
应用场景描述
1. 功能菌株筛选:基于代谢产物与性能的关联评分,可快速筛选与目标功能(如抑菌、肠道健康、免疫调节)显著相关的菌株与代谢标记物,缩短菌株筛选周期; 2. 代谢通路优化:通过通路通量与性能的关联分析,可定位目标产物对应的关键通路与关键酶,支撑代谢工程改造与发酵条件优化,提升目标代谢产物产量; 3. 发酵工艺标准化:基于整合后的数据集形成不同菌株、不同目标产物的标准培养条件与参数库,支撑发酵SOP制定,实现不同批次实验的标准化管控。
  • 数据格式:

    xlsx

  • 数据更新频率:

    年更新

  • 数据量:

    2001

样例数据
数据编号 菌株名称 菌株用途方向 培养条件 抑菌活性指数(%) 酸胆耐受率(%) 生长速率(h⁻¹) 代谢产物类别 关键代谢产物名称 代谢产物浓度(mg/L) 性能关联系数(r) 显著性水平(p) 综合关联评分 功能关联结论 株系编号 代谢通路名称 关键代谢酶 反应类型 底物名称 底物浓度 (mmol/L) 产物浓度 (mmol/L) 通量值 (mmol/gDCW·h) 选择性指数 能量利用方式 基因表达特征 环境条件摘要 系统协同性指数 综合代谢性能评分 D0001 地衣芽孢杆菌 饲料防病 37℃、pH7.2、通气量0.8 L/min 79.1 91.7 0.314 短链脂肪酸 丁酸 70.6 -0.27 0.04217 26 丁酸与目标性能呈显著负相关(r=-0.27, p=0.04217) Lp-08 谷氨酸合成途径 己糖激酶(HK) 氧化还原反应 核糖-5-磷酸 17.12 15.53 9.01 0.94 糖酵解供能 下调0.9倍 pH6.0,35℃,搅拌300rpm 0.71 81 附件下载
数据结构样例
数据编号 菌株名称 菌株用途方向 培养条件 抑菌活性指数(%) 酸胆耐受率(%) 生长速率(h⁻¹) 代谢产物类别 关键代谢产物名称 代谢产物浓度(mg/L) 性能关联系数(r) 显著性水平(p) 综合关联评分 功能关联结论 株系编号 代谢通路名称 关键代谢酶 反应类型 底物名称 底物浓度 (mmol/L) 产物浓度 (mmol/L) 通量值 (mmol/gDCW·h) 选择性指数 能量利用方式 基因表达特征 环境条件摘要 系统协同性指数 综合代谢性能评分
数据状态
  • 2026-09-09

    数据知识产权登记完成